Protein–RNA interactions for Protein: P51675

Ccr1, C-C chemokine receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr1P51675 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccr1P51675 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccr1P51675 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccr1P51675 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccr1P51675 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccr1P51675 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccr1P51675 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccr1P51675 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccr1P51675 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccr1P51675 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccr1P51675 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccr1P51675 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccr1P51675 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccr1P51675 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccr1P51675 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccr1P51675 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccr1P51675 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccr1P51675 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccr1P51675 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccr1P51675 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccr1P51675 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccr1P51675 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccr1P51675 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccr1P51675 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccr1P51675 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccr1P51675 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccr1P51675 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccr1P51675 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccr1P51675 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccr1P51675 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccr1P51675 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccr1P51675 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccr1P51675 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccr1P51675 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccr1P51675 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccr1P51675 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccr1P51675 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccr1P51675 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccr1P51675 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccr1P51675 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccr1P51675 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccr1P51675 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccr1P51675 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccr1P51675 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccr1P51675 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccr1P51675 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccr1P51675 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccr1P51675 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccr1P51675 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccr1P51675 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccr1P51675 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccr1P51675 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccr1P51675 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccr1P51675 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccr1P51675 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccr1P51675 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccr1P51675 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms