Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gpc4P51655 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gpc4P51655 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gpc4P51655 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gpc4P51655 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gpc4P51655 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpc4P51655 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpc4P51655 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpc4P51655 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpc4P51655 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpc4P51655 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpc4P51655 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpc4P51655 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpc4P51655 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpc4P51655 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpc4P51655 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpc4P51655 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpc4P51655 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpc4P51655 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpc4P51655 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpc4P51655 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpc4P51655 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpc4P51655 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpc4P51655 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpc4P51655 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpc4P51655 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpc4P51655 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpc4P51655 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpc4P51655 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpc4P51655 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpc4P51655 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpc4P51655 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpc4P51655 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpc4P51655 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gpc4P51655 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc4P51655 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc4P51655 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc4P51655 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc4P51655 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc4P51655 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpc4P51655 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpc4P51655 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpc4P51655 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpc4P51655 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpc4P51655 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpc4P51655 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpc4P51655 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpc4P51655 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpc4P51655 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpc4P51655 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpc4P51655 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpc4P51655 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpc4P51655 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpc4P51655 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpc4P51655 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc4P51655 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc4P51655 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc4P51655 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc4P51655 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpc4P51655 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpc4P51655 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpc4P51655 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc4P51655 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms