Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSNK1EP49674 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSNK1EP49674 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSNK1EP49674 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSNK1EP49674 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSNK1EP49674 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSNK1EP49674 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSNK1EP49674 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSNK1EP49674 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSNK1EP49674 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSNK1EP49674 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSNK1EP49674 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CSNK1EP49674 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSNK1EP49674 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSNK1EP49674 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSNK1EP49674 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CSNK1EP49674 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSNK1EP49674 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSNK1EP49674 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSNK1EP49674 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSNK1EP49674 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSNK1EP49674 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSNK1EP49674 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSNK1EP49674 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSNK1EP49674 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSNK1EP49674 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSNK1EP49674 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSNK1EP49674 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSNK1EP49674 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSNK1EP49674 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSNK1EP49674 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSNK1EP49674 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSNK1EP49674 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CSNK1EP49674 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSNK1EP49674 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSNK1EP49674 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSNK1EP49674 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSNK1EP49674 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSNK1EP49674 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CSNK1EP49674 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSNK1EP49674 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CSNK1EP49674 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms