Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nedd4P46935 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nedd4P46935 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nedd4P46935 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nedd4P46935 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nedd4P46935 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nedd4P46935 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nedd4P46935 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nedd4P46935 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Nedd4P46935 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Nedd4P46935 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nedd4P46935 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nedd4P46935 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nedd4P46935 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nedd4P46935 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nedd4P46935 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nedd4P46935 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nedd4P46935 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nedd4P46935 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nedd4P46935 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nedd4P46935 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nedd4P46935 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nedd4P46935 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nedd4P46935 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nedd4P46935 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nedd4P46935 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nedd4P46935 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nedd4P46935 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nedd4P46935 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nedd4P46935 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nedd4P46935 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Nedd4P46935 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nedd4P46935 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nedd4P46935 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nedd4P46935 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nedd4P46935 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nedd4P46935 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nedd4P46935 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nedd4P46935 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nedd4P46935 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nedd4P46935 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nedd4P46935 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nedd4P46935 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nedd4P46935 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nedd4P46935 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nedd4P46935 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nedd4P46935 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nedd4P46935 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nedd4P46935 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nedd4P46935 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nedd4P46935 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nedd4P46935 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Nedd4P46935 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nedd4P46935 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nedd4P46935 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nedd4P46935 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nedd4P46935 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nedd4P46935 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nedd4P46935 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nedd4P46935 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nedd4P46935 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nedd4P46935 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nedd4P46935 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nedd4P46935 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nedd4P46935 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nedd4P46935 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nedd4P46935 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nedd4P46935 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Nedd4P46935 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nedd4P46935 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nedd4P46935 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nedd4P46935 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nedd4P46935 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nedd4P46935 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Nedd4P46935 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Nedd4P46935 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nedd4P46935 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nedd4P46935 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nedd4P46935 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Nedd4P46935 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nedd4P46935 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nedd4P46935 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nedd4P46935 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nedd4P46935 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nedd4P46935 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nedd4P46935 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nedd4P46935 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nedd4P46935 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nedd4P46935 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nedd4P46935 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nedd4P46935 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Nedd4P46935 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nedd4P46935 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nedd4P46935 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nedd4P46935 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nedd4P46935 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Nedd4P46935 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nedd4P46935 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nedd4P46935 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Nedd4P46935 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms