Protein–RNA interactions for Protein: P46737

Brcc3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brcc3P46737 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brcc3P46737 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brcc3P46737 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brcc3P46737 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brcc3P46737 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brcc3P46737 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Brcc3P46737 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brcc3P46737 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brcc3P46737 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Brcc3P46737 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brcc3P46737 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brcc3P46737 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brcc3P46737 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brcc3P46737 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brcc3P46737 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brcc3P46737 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brcc3P46737 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brcc3P46737 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brcc3P46737 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brcc3P46737 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brcc3P46737 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brcc3P46737 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Brcc3P46737 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brcc3P46737 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brcc3P46737 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brcc3P46737 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brcc3P46737 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brcc3P46737 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brcc3P46737 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brcc3P46737 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brcc3P46737 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brcc3P46737 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brcc3P46737 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brcc3P46737 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brcc3P46737 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brcc3P46737 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brcc3P46737 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brcc3P46737 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brcc3P46737 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Brcc3P46737 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brcc3P46737 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brcc3P46737 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brcc3P46737 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brcc3P46737 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brcc3P46737 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brcc3P46737 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brcc3P46737 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brcc3P46737 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brcc3P46737 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brcc3P46737 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brcc3P46737 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brcc3P46737 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brcc3P46737 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brcc3P46737 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Brcc3P46737 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brcc3P46737 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms