Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdkn1bP46414 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms