Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSFMP43897 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSFMP43897 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSFMP43897 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TSFMP43897 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSFMP43897 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSFMP43897 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSFMP43897 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSFMP43897 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSFMP43897 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSFMP43897 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSFMP43897 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSFMP43897 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSFMP43897 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSFMP43897 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSFMP43897 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSFMP43897 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSFMP43897 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSFMP43897 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSFMP43897 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSFMP43897 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSFMP43897 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSFMP43897 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSFMP43897 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSFMP43897 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSFMP43897 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSFMP43897 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSFMP43897 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSFMP43897 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSFMP43897 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSFMP43897 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSFMP43897 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSFMP43897 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSFMP43897 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSFMP43897 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSFMP43897 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSFMP43897 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSFMP43897 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSFMP43897 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSFMP43897 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSFMP43897 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TSFMP43897 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSFMP43897 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TSFMP43897 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSFMP43897 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSFMP43897 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TSFMP43897 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSFMP43897 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSFMP43897 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSFMP43897 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSFMP43897 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSFMP43897 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSFMP43897 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSFMP43897 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSFMP43897 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSFMP43897 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSFMP43897 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSFMP43897 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSFMP43897 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSFMP43897 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSFMP43897 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSFMP43897 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSFMP43897 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSFMP43897 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSFMP43897 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSFMP43897 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSFMP43897 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSFMP43897 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TSFMP43897 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSFMP43897 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSFMP43897 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSFMP43897 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSFMP43897 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSFMP43897 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TSFMP43897 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSFMP43897 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSFMP43897 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSFMP43897 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSFMP43897 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSFMP43897 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSFMP43897 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TSFMP43897 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSFMP43897 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSFMP43897 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TSFMP43897 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSFMP43897 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSFMP43897 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSFMP43897 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSFMP43897 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSFMP43897 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSFMP43897 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSFMP43897 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSFMP43897 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSFMP43897 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSFMP43897 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSFMP43897 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSFMP43897 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSFMP43897 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSFMP43897 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSFMP43897 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms