Protein–RNA interactions for Protein: P43267

Sox15, Protein SOX-15, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox15P43267 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox15P43267 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox15P43267 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox15P43267 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox15P43267 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox15P43267 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox15P43267 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sox15P43267 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox15P43267 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox15P43267 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox15P43267 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox15P43267 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sox15P43267 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox15P43267 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox15P43267 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox15P43267 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox15P43267 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox15P43267 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox15P43267 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox15P43267 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox15P43267 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox15P43267 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox15P43267 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox15P43267 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox15P43267 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox15P43267 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox15P43267 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox15P43267 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox15P43267 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox15P43267 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox15P43267 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox15P43267 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox15P43267 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox15P43267 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox15P43267 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox15P43267 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox15P43267 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox15P43267 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox15P43267 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox15P43267 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox15P43267 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox15P43267 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox15P43267 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox15P43267 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox15P43267 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox15P43267 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox15P43267 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox15P43267 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox15P43267 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox15P43267 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox15P43267 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox15P43267 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox15P43267 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox15P43267 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox15P43267 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox15P43267 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox15P43267 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox15P43267 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox15P43267 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox15P43267 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox15P43267 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox15P43267 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox15P43267 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox15P43267 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox15P43267 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms