Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
NCAPD3P42695 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
NCAPD3P42695 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.37■■■■■ 4.69
NCAPD3P42695 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC44.37■■■■■ 4.69
NCAPD3P42695 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC44.36■■■■■ 4.69
NCAPD3P42695 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC44.36■■■■■ 4.69
NCAPD3P42695 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
NCAPD3P42695 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
NCAPD3P42695 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
NCAPD3P42695 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC44.34■■■■■ 4.69
NCAPD3P42695 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC44.34■■■■■ 4.69
NCAPD3P42695 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC44.34■■■■■ 4.69
NCAPD3P42695 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
NCAPD3P42695 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
NCAPD3P42695 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.32■■■■■ 4.69
NCAPD3P42695 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
NCAPD3P42695 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
NCAPD3P42695 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC44.3■■■■■ 4.68
NCAPD3P42695 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
NCAPD3P42695 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
NCAPD3P42695 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
NCAPD3P42695 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC44.27■■■■■ 4.68
NCAPD3P42695 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
NCAPD3P42695 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
NCAPD3P42695 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
NCAPD3P42695 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
NCAPD3P42695 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
NCAPD3P42695 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
NCAPD3P42695 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
NCAPD3P42695 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC44.25■■■■■ 4.67
NCAPD3P42695 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
NCAPD3P42695 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC44.24■■■■■ 4.67
NCAPD3P42695 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.24■■■■■ 4.67
NCAPD3P42695 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC44.23■■■■■ 4.67
NCAPD3P42695 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
NCAPD3P42695 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC44.21■■■■■ 4.67
NCAPD3P42695 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC44.2■■■■■ 4.67
NCAPD3P42695 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
NCAPD3P42695 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
NCAPD3P42695 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.67
NCAPD3P42695 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC44.19■■■■■ 4.66
NCAPD3P42695 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC44.18■■■■■ 4.66
NCAPD3P42695 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
NCAPD3P42695 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC44.18■■■■■ 4.66
NCAPD3P42695 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
NCAPD3P42695 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
NCAPD3P42695 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC44.17■■■■■ 4.66
NCAPD3P42695 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC44.17■■■■■ 4.66
NCAPD3P42695 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC44.17■■■■■ 4.66
NCAPD3P42695 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC44.17■■■■■ 4.66
NCAPD3P42695 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
NCAPD3P42695 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC44.17■■■■■ 4.66
NCAPD3P42695 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
NCAPD3P42695 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC44.15■■■■■ 4.66
NCAPD3P42695 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
NCAPD3P42695 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC44.15■■■■■ 4.66
NCAPD3P42695 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
NCAPD3P42695 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC44.14■■■■■ 4.66
NCAPD3P42695 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
NCAPD3P42695 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
NCAPD3P42695 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
NCAPD3P42695 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
NCAPD3P42695 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC44.13■■■■■ 4.65
NCAPD3P42695 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
NCAPD3P42695 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
NCAPD3P42695 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
NCAPD3P42695 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC44.12■■■■■ 4.65
NCAPD3P42695 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
NCAPD3P42695 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC44.11■■■■■ 4.65
NCAPD3P42695 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC44.11■■■■■ 4.65
NCAPD3P42695 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
NCAPD3P42695 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
NCAPD3P42695 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
NCAPD3P42695 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
NCAPD3P42695 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC44.08■■■■■ 4.65
NCAPD3P42695 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
NCAPD3P42695 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC44.08■■■■■ 4.65
NCAPD3P42695 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
NCAPD3P42695 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
NCAPD3P42695 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC44.08■■■■■ 4.65
NCAPD3P42695 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
NCAPD3P42695 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC44.08■■■■■ 4.65
NCAPD3P42695 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC44.07■■■■■ 4.65
NCAPD3P42695 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
NCAPD3P42695 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
NCAPD3P42695 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
NCAPD3P42695 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC44.07■■■■■ 4.65
NCAPD3P42695 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
NCAPD3P42695 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
NCAPD3P42695 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
NCAPD3P42695 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC44.04■■■■■ 4.64
NCAPD3P42695 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.04■■■■■ 4.64
NCAPD3P42695 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC44.03■■■■■ 4.64
NCAPD3P42695 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC44.03■■■■■ 4.64
NCAPD3P42695 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
NCAPD3P42695 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC44.03■■■■■ 4.64
NCAPD3P42695 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC44.02■■■■■ 4.64
NCAPD3P42695 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
NCAPD3P42695 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
NCAPD3P42695 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms