Protein–RNA interactions for Protein: P41218

MNDA, Myeloid cell nuclear differentiation antigen, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNDAP41218 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MNDAP41218 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MNDAP41218 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MNDAP41218 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MNDAP41218 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MNDAP41218 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MNDAP41218 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MNDAP41218 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MNDAP41218 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MNDAP41218 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MNDAP41218 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MNDAP41218 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MNDAP41218 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MNDAP41218 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MNDAP41218 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MNDAP41218 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MNDAP41218 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MNDAP41218 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MNDAP41218 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MNDAP41218 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MNDAP41218 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MNDAP41218 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MNDAP41218 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MNDAP41218 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MNDAP41218 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MNDAP41218 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MNDAP41218 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MNDAP41218 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MNDAP41218 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MNDAP41218 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MNDAP41218 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MNDAP41218 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MNDAP41218 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MNDAP41218 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MNDAP41218 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MNDAP41218 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MNDAP41218 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MNDAP41218 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MNDAP41218 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MNDAP41218 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MNDAP41218 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MNDAP41218 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MNDAP41218 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MNDAP41218 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MNDAP41218 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MNDAP41218 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MNDAP41218 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MNDAP41218 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MNDAP41218 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MNDAP41218 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MNDAP41218 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MNDAP41218 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MNDAP41218 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MNDAP41218 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MNDAP41218 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MNDAP41218 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MNDAP41218 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MNDAP41218 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MNDAP41218 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
MNDAP41218 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MNDAP41218 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MNDAP41218 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MNDAP41218 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MNDAP41218 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MNDAP41218 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MNDAP41218 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MNDAP41218 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MNDAP41218 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MNDAP41218 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MNDAP41218 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MNDAP41218 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MNDAP41218 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MNDAP41218 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MNDAP41218 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MNDAP41218 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MNDAP41218 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MNDAP41218 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MNDAP41218 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MNDAP41218 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MNDAP41218 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MNDAP41218 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MNDAP41218 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MNDAP41218 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MNDAP41218 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MNDAP41218 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MNDAP41218 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MNDAP41218 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MNDAP41218 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MNDAP41218 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MNDAP41218 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MNDAP41218 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MNDAP41218 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MNDAP41218 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MNDAP41218 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MNDAP41218 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MNDAP41218 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MNDAP41218 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MNDAP41218 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MNDAP41218 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MNDAP41218 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms