Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
ITGAEP38570 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
ITGAEP38570 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
ITGAEP38570 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
ITGAEP38570 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
ITGAEP38570 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
ITGAEP38570 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
ITGAEP38570 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
ITGAEP38570 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
ITGAEP38570 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
ITGAEP38570 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
ITGAEP38570 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
ITGAEP38570 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ITGAEP38570 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ITGAEP38570 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
ITGAEP38570 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ITGAEP38570 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
ITGAEP38570 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
ITGAEP38570 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ITGAEP38570 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
ITGAEP38570 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
ITGAEP38570 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ITGAEP38570 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ITGAEP38570 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
ITGAEP38570 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
ITGAEP38570 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
ITGAEP38570 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
ITGAEP38570 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC37.01■■■■□ 3.52
ITGAEP38570 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
ITGAEP38570 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ITGAEP38570 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ITGAEP38570 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ITGAEP38570 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ITGAEP38570 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ITGAEP38570 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ITGAEP38570 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ITGAEP38570 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ITGAEP38570 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ITGAEP38570 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ITGAEP38570 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
ITGAEP38570 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
ITGAEP38570 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
ITGAEP38570 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
ITGAEP38570 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
ITGAEP38570 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
ITGAEP38570 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
ITGAEP38570 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ITGAEP38570 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
ITGAEP38570 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
ITGAEP38570 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
ITGAEP38570 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
ITGAEP38570 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
ITGAEP38570 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ITGAEP38570 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
ITGAEP38570 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
ITGAEP38570 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ITGAEP38570 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ITGAEP38570 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
ITGAEP38570 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ITGAEP38570 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ITGAEP38570 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
ITGAEP38570 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ITGAEP38570 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ITGAEP38570 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
ITGAEP38570 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ITGAEP38570 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ITGAEP38570 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ITGAEP38570 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
ITGAEP38570 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
ITGAEP38570 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
ITGAEP38570 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
ITGAEP38570 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
ITGAEP38570 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
ITGAEP38570 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
ITGAEP38570 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
ITGAEP38570 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
ITGAEP38570 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
ITGAEP38570 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ITGAEP38570 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ITGAEP38570 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ITGAEP38570 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ITGAEP38570 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
ITGAEP38570 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
ITGAEP38570 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ITGAEP38570 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ITGAEP38570 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ITGAEP38570 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ITGAEP38570 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ITGAEP38570 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
ITGAEP38570 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ITGAEP38570 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ITGAEP38570 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ITGAEP38570 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ITGAEP38570 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ITGAEP38570 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ITGAEP38570 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ITGAEP38570 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ITGAEP38570 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ITGAEP38570 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ITGAEP38570 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms