Protein–RNA interactions for Protein: P35918

Kdr, Vascular endothelial growth factor receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdrP35918 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
KdrP35918 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KdrP35918 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KdrP35918 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KdrP35918 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KdrP35918 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KdrP35918 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KdrP35918 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KdrP35918 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KdrP35918 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
KdrP35918 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
KdrP35918 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KdrP35918 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
KdrP35918 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
KdrP35918 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KdrP35918 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
KdrP35918 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KdrP35918 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
KdrP35918 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KdrP35918 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
KdrP35918 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KdrP35918 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KdrP35918 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KdrP35918 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KdrP35918 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KdrP35918 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
KdrP35918 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
KdrP35918 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
KdrP35918 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
KdrP35918 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
KdrP35918 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
KdrP35918 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
KdrP35918 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KdrP35918 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
KdrP35918 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KdrP35918 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KdrP35918 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KdrP35918 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KdrP35918 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
KdrP35918 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
KdrP35918 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
KdrP35918 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KdrP35918 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
KdrP35918 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
KdrP35918 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
KdrP35918 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
KdrP35918 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
KdrP35918 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
KdrP35918 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
KdrP35918 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
KdrP35918 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
KdrP35918 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
KdrP35918 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
KdrP35918 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
KdrP35918 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
KdrP35918 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
KdrP35918 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
KdrP35918 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
KdrP35918 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
KdrP35918 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
KdrP35918 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
KdrP35918 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
KdrP35918 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
KdrP35918 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
KdrP35918 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
KdrP35918 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
KdrP35918 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
KdrP35918 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
KdrP35918 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
KdrP35918 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
KdrP35918 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
KdrP35918 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
KdrP35918 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
KdrP35918 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
KdrP35918 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
KdrP35918 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
KdrP35918 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
KdrP35918 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
KdrP35918 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
KdrP35918 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
KdrP35918 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
KdrP35918 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
KdrP35918 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
KdrP35918 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
KdrP35918 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
KdrP35918 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
KdrP35918 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.49
KdrP35918 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KdrP35918 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KdrP35918 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KdrP35918 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KdrP35918 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KdrP35918 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KdrP35918 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
KdrP35918 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
KdrP35918 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
KdrP35918 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
KdrP35918 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
KdrP35918 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
KdrP35918 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms