Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
FLT4P35916 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
FLT4P35916 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
FLT4P35916 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
FLT4P35916 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
FLT4P35916 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
FLT4P35916 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
FLT4P35916 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
FLT4P35916 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
FLT4P35916 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
FLT4P35916 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
FLT4P35916 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
FLT4P35916 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
FLT4P35916 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
FLT4P35916 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
FLT4P35916 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
FLT4P35916 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
FLT4P35916 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
FLT4P35916 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
FLT4P35916 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
FLT4P35916 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
FLT4P35916 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
FLT4P35916 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
FLT4P35916 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
FLT4P35916 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
FLT4P35916 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
FLT4P35916 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
FLT4P35916 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
FLT4P35916 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
FLT4P35916 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
FLT4P35916 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
FLT4P35916 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
FLT4P35916 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
FLT4P35916 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
FLT4P35916 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
FLT4P35916 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
FLT4P35916 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
FLT4P35916 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
FLT4P35916 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
FLT4P35916 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
FLT4P35916 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
FLT4P35916 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
FLT4P35916 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
FLT4P35916 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
FLT4P35916 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
FLT4P35916 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
FLT4P35916 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
FLT4P35916 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
FLT4P35916 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
FLT4P35916 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
FLT4P35916 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
FLT4P35916 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
FLT4P35916 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
FLT4P35916 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
FLT4P35916 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
FLT4P35916 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
FLT4P35916 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.82
FLT4P35916 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
FLT4P35916 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
FLT4P35916 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
FLT4P35916 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
FLT4P35916 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
FLT4P35916 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
FLT4P35916 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
FLT4P35916 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
FLT4P35916 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
FLT4P35916 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
FLT4P35916 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
FLT4P35916 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
FLT4P35916 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
FLT4P35916 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
FLT4P35916 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
FLT4P35916 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
FLT4P35916 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
FLT4P35916 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
FLT4P35916 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
FLT4P35916 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
FLT4P35916 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
FLT4P35916 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
FLT4P35916 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
FLT4P35916 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
FLT4P35916 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
FLT4P35916 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
FLT4P35916 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
FLT4P35916 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
FLT4P35916 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
FLT4P35916 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
FLT4P35916 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
FLT4P35916 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
FLT4P35916 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
FLT4P35916 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
FLT4P35916 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
FLT4P35916 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
FLT4P35916 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
FLT4P35916 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FLT4P35916 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FLT4P35916 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
FLT4P35916 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FLT4P35916 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FLT4P35916 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms