Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PtprkP35822 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PtprkP35822 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PtprkP35822 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PtprkP35822 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PtprkP35822 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PtprkP35822 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PtprkP35822 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PtprkP35822 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
PtprkP35822 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
PtprkP35822 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PtprkP35822 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PtprkP35822 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PtprkP35822 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PtprkP35822 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PtprkP35822 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PtprkP35822 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PtprkP35822 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PtprkP35822 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
PtprkP35822 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PtprkP35822 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PtprkP35822 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PtprkP35822 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PtprkP35822 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PtprkP35822 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PtprkP35822 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PtprkP35822 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PtprkP35822 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
PtprkP35822 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PtprkP35822 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PtprkP35822 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PtprkP35822 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PtprkP35822 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PtprkP35822 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PtprkP35822 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PtprkP35822 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PtprkP35822 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
PtprkP35822 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PtprkP35822 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
PtprkP35822 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
PtprkP35822 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PtprkP35822 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PtprkP35822 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PtprkP35822 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PtprkP35822 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PtprkP35822 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PtprkP35822 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PtprkP35822 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PtprkP35822 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PtprkP35822 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PtprkP35822 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PtprkP35822 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PtprkP35822 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PtprkP35822 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PtprkP35822 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
PtprkP35822 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PtprkP35822 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PtprkP35822 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PtprkP35822 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PtprkP35822 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PtprkP35822 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PtprkP35822 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PtprkP35822 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PtprkP35822 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PtprkP35822 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PtprkP35822 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PtprkP35822 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PtprkP35822 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PtprkP35822 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PtprkP35822 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PtprkP35822 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PtprkP35822 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PtprkP35822 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PtprkP35822 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
PtprkP35822 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PtprkP35822 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PtprkP35822 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PtprkP35822 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PtprkP35822 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PtprkP35822 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PtprkP35822 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PtprkP35822 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PtprkP35822 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PtprkP35822 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
PtprkP35822 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PtprkP35822 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PtprkP35822 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PtprkP35822 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PtprkP35822 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PtprkP35822 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
PtprkP35822 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PtprkP35822 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PtprkP35822 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
PtprkP35822 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PtprkP35822 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PtprkP35822 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
PtprkP35822 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PtprkP35822 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PtprkP35822 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PtprkP35822 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms