Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYLC1P35663 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYLC1P35663 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYLC1P35663 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYLC1P35663 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYLC1P35663 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYLC1P35663 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYLC1P35663 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYLC1P35663 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYLC1P35663 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYLC1P35663 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYLC1P35663 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYLC1P35663 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYLC1P35663 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYLC1P35663 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYLC1P35663 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYLC1P35663 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYLC1P35663 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYLC1P35663 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYLC1P35663 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYLC1P35663 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYLC1P35663 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYLC1P35663 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYLC1P35663 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYLC1P35663 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYLC1P35663 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYLC1P35663 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYLC1P35663 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYLC1P35663 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYLC1P35663 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYLC1P35663 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYLC1P35663 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYLC1P35663 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYLC1P35663 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYLC1P35663 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYLC1P35663 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYLC1P35663 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYLC1P35663 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYLC1P35663 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYLC1P35663 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYLC1P35663 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYLC1P35663 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYLC1P35663 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYLC1P35663 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYLC1P35663 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYLC1P35663 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYLC1P35663 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CYLC1P35663 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYLC1P35663 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYLC1P35663 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYLC1P35663 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYLC1P35663 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYLC1P35663 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYLC1P35663 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYLC1P35663 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYLC1P35663 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYLC1P35663 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYLC1P35663 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYLC1P35663 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CYLC1P35663 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYLC1P35663 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYLC1P35663 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYLC1P35663 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYLC1P35663 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CYLC1P35663 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CYLC1P35663 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYLC1P35663 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CYLC1P35663 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CYLC1P35663 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CYLC1P35663 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYLC1P35663 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CYLC1P35663 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CYLC1P35663 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYLC1P35663 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYLC1P35663 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYLC1P35663 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYLC1P35663 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYLC1P35663 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYLC1P35663 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYLC1P35663 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYLC1P35663 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYLC1P35663 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYLC1P35663 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYLC1P35663 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYLC1P35663 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYLC1P35663 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYLC1P35663 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CYLC1P35663 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYLC1P35663 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CYLC1P35663 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYLC1P35663 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CYLC1P35663 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYLC1P35663 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYLC1P35663 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CYLC1P35663 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CYLC1P35663 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CYLC1P35663 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms