Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN7P35236 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN7P35236 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN7P35236 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN7P35236 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN7P35236 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN7P35236 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN7P35236 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN7P35236 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN7P35236 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN7P35236 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN7P35236 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN7P35236 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN7P35236 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN7P35236 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN7P35236 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN7P35236 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN7P35236 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN7P35236 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN7P35236 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN7P35236 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN7P35236 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN7P35236 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN7P35236 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN7P35236 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN7P35236 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN7P35236 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN7P35236 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN7P35236 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN7P35236 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN7P35236 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN7P35236 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN7P35236 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN7P35236 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN7P35236 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN7P35236 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN7P35236 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN7P35236 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN7P35236 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN7P35236 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN7P35236 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN7P35236 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN7P35236 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN7P35236 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN7P35236 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN7P35236 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN7P35236 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN7P35236 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN7P35236 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN7P35236 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN7P35236 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN7P35236 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN7P35236 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN7P35236 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN7P35236 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN7P35236 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN7P35236 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN7P35236 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN7P35236 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN7P35236 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN7P35236 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN7P35236 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN7P35236 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN7P35236 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPN7P35236 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN7P35236 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN7P35236 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN7P35236 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN7P35236 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN7P35236 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN7P35236 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN7P35236 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN7P35236 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN7P35236 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN7P35236 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN7P35236 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN7P35236 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN7P35236 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN7P35236 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN7P35236 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN7P35236 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN7P35236 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN7P35236 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN7P35236 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN7P35236 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN7P35236 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN7P35236 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN7P35236 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN7P35236 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN7P35236 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN7P35236 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN7P35236 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN7P35236 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN7P35236 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN7P35236 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN7P35236 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN7P35236 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN7P35236 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms