Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoc3P33622 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoc3P33622 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoc3P33622 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoc3P33622 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apoc3P33622 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apoc3P33622 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apoc3P33622 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apoc3P33622 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apoc3P33622 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apoc3P33622 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apoc3P33622 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apoc3P33622 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apoc3P33622 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apoc3P33622 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apoc3P33622 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apoc3P33622 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apoc3P33622 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apoc3P33622 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Apoc3P33622 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apoc3P33622 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apoc3P33622 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apoc3P33622 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apoc3P33622 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apoc3P33622 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apoc3P33622 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apoc3P33622 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apoc3P33622 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apoc3P33622 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apoc3P33622 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apoc3P33622 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apoc3P33622 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apoc3P33622 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apoc3P33622 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apoc3P33622 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apoc3P33622 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apoc3P33622 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apoc3P33622 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apoc3P33622 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apoc3P33622 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apoc3P33622 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apoc3P33622 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apoc3P33622 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apoc3P33622 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Apoc3P33622 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Apoc3P33622 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms