Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SsbP32067 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SsbP32067 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SsbP32067 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SsbP32067 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SsbP32067 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SsbP32067 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SsbP32067 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SsbP32067 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SsbP32067 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SsbP32067 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SsbP32067 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SsbP32067 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SsbP32067 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SsbP32067 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SsbP32067 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SsbP32067 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SsbP32067 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SsbP32067 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SsbP32067 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SsbP32067 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SsbP32067 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SsbP32067 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SsbP32067 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SsbP32067 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SsbP32067 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SsbP32067 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SsbP32067 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SsbP32067 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SsbP32067 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SsbP32067 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SsbP32067 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SsbP32067 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SsbP32067 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SsbP32067 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SsbP32067 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SsbP32067 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SsbP32067 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SsbP32067 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SsbP32067 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SsbP32067 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SsbP32067 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
SsbP32067 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SsbP32067 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SsbP32067 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SsbP32067 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SsbP32067 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SsbP32067 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SsbP32067 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SsbP32067 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SsbP32067 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SsbP32067 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SsbP32067 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SsbP32067 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SsbP32067 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SsbP32067 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SsbP32067 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SsbP32067 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SsbP32067 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SsbP32067 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SsbP32067 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SsbP32067 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SsbP32067 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SsbP32067 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SsbP32067 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SsbP32067 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SsbP32067 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SsbP32067 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SsbP32067 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SsbP32067 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SsbP32067 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SsbP32067 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SsbP32067 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SsbP32067 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SsbP32067 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SsbP32067 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SsbP32067 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SsbP32067 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SsbP32067 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SsbP32067 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SsbP32067 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SsbP32067 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SsbP32067 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SsbP32067 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SsbP32067 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SsbP32067 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SsbP32067 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SsbP32067 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SsbP32067 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SsbP32067 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SsbP32067 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SsbP32067 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SsbP32067 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SsbP32067 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SsbP32067 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SsbP32067 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SsbP32067 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SsbP32067 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SsbP32067 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SsbP32067 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms