Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Hoxa10P31310 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa10P31310 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa10P31310 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa10P31310 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa10P31310 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa10P31310 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa10P31310 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa10P31310 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa10P31310 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa10P31310 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa10P31310 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa10P31310 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa10P31310 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa10P31310 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa10P31310 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa10P31310 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa10P31310 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa10P31310 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa10P31310 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa10P31310 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa10P31310 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa10P31310 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa10P31310 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa10P31310 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa10P31310 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa10P31310 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa10P31310 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa10P31310 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa10P31310 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa10P31310 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa10P31310 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa10P31310 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa10P31310 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa10P31310 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxa10P31310 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxa10P31310 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxa10P31310 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxa10P31310 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxa10P31310 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa10P31310 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa10P31310 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa10P31310 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa10P31310 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa10P31310 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa10P31310 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa10P31310 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms