Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa2P31245 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa2P31245 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa2P31245 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa2P31245 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa2P31245 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa2P31245 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa2P31245 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa2P31245 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa2P31245 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa2P31245 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa2P31245 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa2P31245 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa2P31245 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxa2P31245 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms