Protein–RNA interactions for Protein: P30041

PRDX6, Peroxiredoxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX6P30041 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDX6P30041 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDX6P30041 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDX6P30041 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDX6P30041 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDX6P30041 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDX6P30041 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDX6P30041 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDX6P30041 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDX6P30041 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDX6P30041 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDX6P30041 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDX6P30041 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDX6P30041 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRDX6P30041 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PRDX6P30041 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRDX6P30041 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDX6P30041 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDX6P30041 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDX6P30041 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDX6P30041 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDX6P30041 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDX6P30041 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDX6P30041 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDX6P30041 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDX6P30041 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDX6P30041 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDX6P30041 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDX6P30041 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDX6P30041 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDX6P30041 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDX6P30041 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDX6P30041 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDX6P30041 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDX6P30041 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDX6P30041 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDX6P30041 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDX6P30041 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDX6P30041 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDX6P30041 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDX6P30041 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDX6P30041 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDX6P30041 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDX6P30041 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDX6P30041 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDX6P30041 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRDX6P30041 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRDX6P30041 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDX6P30041 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDX6P30041 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDX6P30041 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDX6P30041 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDX6P30041 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDX6P30041 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDX6P30041 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDX6P30041 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDX6P30041 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDX6P30041 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDX6P30041 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDX6P30041 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDX6P30041 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDX6P30041 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDX6P30041 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDX6P30041 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDX6P30041 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDX6P30041 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDX6P30041 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDX6P30041 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDX6P30041 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDX6P30041 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDX6P30041 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDX6P30041 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDX6P30041 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDX6P30041 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDX6P30041 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDX6P30041 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDX6P30041 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDX6P30041 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDX6P30041 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms