Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD34P28906 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD34P28906 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD34P28906 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD34P28906 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD34P28906 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CD34P28906 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD34P28906 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD34P28906 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD34P28906 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD34P28906 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD34P28906 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD34P28906 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD34P28906 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD34P28906 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD34P28906 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD34P28906 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD34P28906 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD34P28906 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD34P28906 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD34P28906 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD34P28906 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD34P28906 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CD34P28906 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CD34P28906 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CD34P28906 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CD34P28906 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CD34P28906 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CD34P28906 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CD34P28906 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CD34P28906 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CD34P28906 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CD34P28906 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CD34P28906 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CD34P28906 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CD34P28906 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CD34P28906 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CD34P28906 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CD34P28906 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CD34P28906 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CD34P28906 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CD34P28906 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CD34P28906 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CD34P28906 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CD34P28906 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CD34P28906 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CD34P28906 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CD34P28906 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CD34P28906 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CD34P28906 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CD34P28906 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CD34P28906 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CD34P28906 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CD34P28906 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CD34P28906 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CD34P28906 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CD34P28906 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CD34P28906 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CD34P28906 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CD34P28906 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CD34P28906 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CD34P28906 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CD34P28906 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CD34P28906 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CD34P28906 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CD34P28906 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CD34P28906 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CD34P28906 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CD34P28906 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CD34P28906 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CD34P28906 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD34P28906 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD34P28906 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD34P28906 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD34P28906 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD34P28906 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD34P28906 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD34P28906 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD34P28906 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD34P28906 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD34P28906 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CD34P28906 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD34P28906 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD34P28906 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CD34P28906 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD34P28906 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD34P28906 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD34P28906 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD34P28906 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD34P28906 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD34P28906 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD34P28906 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD34P28906 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD34P28906 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD34P28906 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD34P28906 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD34P28906 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD34P28906 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CD34P28906 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CD34P28906 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms