Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PtprmP28828 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PtprmP28828 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PtprmP28828 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PtprmP28828 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
PtprmP28828 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PtprmP28828 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PtprmP28828 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PtprmP28828 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PtprmP28828 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PtprmP28828 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PtprmP28828 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PtprmP28828 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PtprmP28828 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PtprmP28828 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PtprmP28828 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PtprmP28828 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PtprmP28828 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
PtprmP28828 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PtprmP28828 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PtprmP28828 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PtprmP28828 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PtprmP28828 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PtprmP28828 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PtprmP28828 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PtprmP28828 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PtprmP28828 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PtprmP28828 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PtprmP28828 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PtprmP28828 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PtprmP28828 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PtprmP28828 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
PtprmP28828 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PtprmP28828 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PtprmP28828 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PtprmP28828 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PtprmP28828 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PtprmP28828 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
PtprmP28828 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PtprmP28828 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PtprmP28828 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PtprmP28828 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PtprmP28828 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PtprmP28828 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PtprmP28828 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PtprmP28828 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PtprmP28828 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
PtprmP28828 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PtprmP28828 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PtprmP28828 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PtprmP28828 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PtprmP28828 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PtprmP28828 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PtprmP28828 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PtprmP28828 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PtprmP28828 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PtprmP28828 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PtprmP28828 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
PtprmP28828 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PtprmP28828 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PtprmP28828 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PtprmP28828 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PtprmP28828 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PtprmP28828 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PtprmP28828 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PtprmP28828 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PtprmP28828 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PtprmP28828 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PtprmP28828 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PtprmP28828 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PtprmP28828 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PtprmP28828 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PtprmP28828 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PtprmP28828 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PtprmP28828 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PtprmP28828 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PtprmP28828 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PtprmP28828 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PtprmP28828 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PtprmP28828 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PtprmP28828 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PtprmP28828 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PtprmP28828 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PtprmP28828 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PtprmP28828 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PtprmP28828 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PtprmP28828 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
PtprmP28828 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
PtprmP28828 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PtprmP28828 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PtprmP28828 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PtprmP28828 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PtprmP28828 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
PtprmP28828 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PtprmP28828 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PtprmP28828 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PtprmP28828 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PtprmP28828 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
PtprmP28828 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PtprmP28828 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
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