Protein–RNA interactions for Protein: P28799

GRN, Granulins, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRNP28799 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRNP28799 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRNP28799 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRNP28799 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRNP28799 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRNP28799 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRNP28799 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRNP28799 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRNP28799 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRNP28799 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRNP28799 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRNP28799 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRNP28799 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRNP28799 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRNP28799 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRNP28799 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRNP28799 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRNP28799 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRNP28799 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRNP28799 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRNP28799 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRNP28799 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRNP28799 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRNP28799 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRNP28799 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRNP28799 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRNP28799 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRNP28799 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GRNP28799 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRNP28799 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRNP28799 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GRNP28799 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GRNP28799 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRNP28799 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GRNP28799 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRNP28799 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRNP28799 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRNP28799 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRNP28799 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRNP28799 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRNP28799 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRNP28799 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRNP28799 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GRNP28799 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRNP28799 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRNP28799 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRNP28799 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRNP28799 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GRNP28799 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRNP28799 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRNP28799 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRNP28799 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRNP28799 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRNP28799 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRNP28799 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRNP28799 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRNP28799 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRNP28799 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRNP28799 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRNP28799 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRNP28799 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRNP28799 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRNP28799 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRNP28799 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRNP28799 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRNP28799 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRNP28799 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRNP28799 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRNP28799 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GRNP28799 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRNP28799 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRNP28799 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRNP28799 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRNP28799 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRNP28799 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRNP28799 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRNP28799 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRNP28799 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRNP28799 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRNP28799 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRNP28799 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRNP28799 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GRNP28799 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRNP28799 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRNP28799 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRNP28799 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRNP28799 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRNP28799 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRNP28799 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRNP28799 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRNP28799 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRNP28799 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRNP28799 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GRNP28799 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GRNP28799 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRNP28799 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRNP28799 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRNP28799 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRNP28799 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRNP28799 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms