Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa2P28309 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa2P28309 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa2P28309 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa2P28309 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa2P28309 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa2P28309 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa2P28309 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms