Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psmb9P28076 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Psmb9P28076 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Psmb9P28076 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Psmb9P28076 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psmb9P28076 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psmb9P28076 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psmb9P28076 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Psmb9P28076 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psmb9P28076 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psmb9P28076 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psmb9P28076 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psmb9P28076 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psmb9P28076 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psmb9P28076 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psmb9P28076 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psmb9P28076 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psmb9P28076 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psmb9P28076 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psmb9P28076 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Psmb9P28076 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Psmb9P28076 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Psmb9P28076 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Psmb9P28076 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Psmb9P28076 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Psmb9P28076 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Psmb9P28076 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Psmb9P28076 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Psmb9P28076 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Psmb9P28076 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Psmb9P28076 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Psmb9P28076 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Psmb9P28076 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Psmb9P28076 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Psmb9P28076 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Psmb9P28076 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Psmb9P28076 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Psmb9P28076 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Psmb9P28076 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Psmb9P28076 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Psmb9P28076 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Psmb9P28076 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Psmb9P28076 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Psmb9P28076 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Psmb9P28076 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Psmb9P28076 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Psmb9P28076 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Psmb9P28076 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Psmb9P28076 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Psmb9P28076 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Psmb9P28076 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Psmb9P28076 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Psmb9P28076 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Psmb9P28076 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Psmb9P28076 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Psmb9P28076 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Psmb9P28076 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Psmb9P28076 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psmb9P28076 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psmb9P28076 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psmb9P28076 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psmb9P28076 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Psmb9P28076 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Psmb9P28076 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Psmb9P28076 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms