Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HLA-DMAP28067 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.6 ms