Protein–RNA interactions for Protein: P25025

CXCR2, C-X-C chemokine receptor type 2, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR2P25025 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCR2P25025 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCR2P25025 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCR2P25025 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCR2P25025 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCR2P25025 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCR2P25025 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCR2P25025 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCR2P25025 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CXCR2P25025 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCR2P25025 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCR2P25025 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCR2P25025 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR2P25025 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR2P25025 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR2P25025 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR2P25025 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR2P25025 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR2P25025 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCR2P25025 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCR2P25025 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCR2P25025 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCR2P25025 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCR2P25025 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCR2P25025 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR2P25025 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR2P25025 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR2P25025 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR2P25025 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR2P25025 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR2P25025 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR2P25025 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR2P25025 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR2P25025 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR2P25025 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR2P25025 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CXCR2P25025 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCR2P25025 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCR2P25025 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCR2P25025 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCR2P25025 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCR2P25025 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCR2P25025 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCR2P25025 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCR2P25025 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCR2P25025 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR2P25025 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR2P25025 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR2P25025 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR2P25025 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR2P25025 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR2P25025 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR2P25025 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms