Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRBP23467 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRBP23467 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRBP23467 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRBP23467 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRBP23467 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRBP23467 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRBP23467 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRBP23467 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRBP23467 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRBP23467 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRBP23467 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRBP23467 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRBP23467 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRBP23467 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRBP23467 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRBP23467 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRBP23467 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRBP23467 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRBP23467 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRBP23467 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRBP23467 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRBP23467 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRBP23467 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRBP23467 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRBP23467 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRBP23467 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRBP23467 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRBP23467 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRBP23467 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRBP23467 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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