Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PparaP23204 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PparaP23204 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PparaP23204 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PparaP23204 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PparaP23204 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PparaP23204 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PparaP23204 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PparaP23204 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PparaP23204 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PparaP23204 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PparaP23204 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PparaP23204 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PparaP23204 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PparaP23204 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PparaP23204 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PparaP23204 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PparaP23204 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PparaP23204 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PparaP23204 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PparaP23204 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PparaP23204 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PparaP23204 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PparaP23204 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PparaP23204 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PparaP23204 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PparaP23204 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PparaP23204 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PparaP23204 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PparaP23204 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PparaP23204 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PparaP23204 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PparaP23204 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PparaP23204 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PparaP23204 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PparaP23204 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PparaP23204 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PparaP23204 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PparaP23204 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PparaP23204 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PparaP23204 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PparaP23204 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PparaP23204 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PparaP23204 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PparaP23204 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PparaP23204 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PparaP23204 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PparaP23204 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PparaP23204 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PparaP23204 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PparaP23204 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PparaP23204 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PparaP23204 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PparaP23204 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PparaP23204 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PparaP23204 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PparaP23204 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PparaP23204 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PparaP23204 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PparaP23204 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PparaP23204 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PparaP23204 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PparaP23204 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PparaP23204 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PparaP23204 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PparaP23204 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PparaP23204 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PparaP23204 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PparaP23204 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PparaP23204 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PparaP23204 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PparaP23204 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PparaP23204 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PparaP23204 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PparaP23204 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PparaP23204 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PparaP23204 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PparaP23204 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PparaP23204 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PparaP23204 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PparaP23204 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PparaP23204 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PparaP23204 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PparaP23204 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PparaP23204 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PparaP23204 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PparaP23204 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PparaP23204 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PparaP23204 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PparaP23204 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PparaP23204 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PparaP23204 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PparaP23204 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PparaP23204 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PparaP23204 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PparaP23204 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PparaP23204 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PparaP23204 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PparaP23204 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PparaP23204 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms