Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPAP23025 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPAP23025 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPAP23025 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
XPAP23025 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPAP23025 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPAP23025 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPAP23025 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPAP23025 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPAP23025 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPAP23025 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPAP23025 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPAP23025 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPAP23025 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPAP23025 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPAP23025 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPAP23025 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPAP23025 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPAP23025 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPAP23025 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPAP23025 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPAP23025 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPAP23025 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPAP23025 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPAP23025 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPAP23025 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
XPAP23025 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
XPAP23025 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPAP23025 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPAP23025 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XPAP23025 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XPAP23025 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XPAP23025 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XPAP23025 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XPAP23025 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XPAP23025 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPAP23025 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPAP23025 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPAP23025 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPAP23025 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPAP23025 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
XPAP23025 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPAP23025 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPAP23025 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
XPAP23025 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
XPAP23025 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPAP23025 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPAP23025 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPAP23025 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPAP23025 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPAP23025 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPAP23025 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPAP23025 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPAP23025 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPAP23025 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPAP23025 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPAP23025 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPAP23025 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPAP23025 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XPAP23025 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XPAP23025 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XPAP23025 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XPAP23025 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XPAP23025 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XPAP23025 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPAP23025 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPAP23025 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPAP23025 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPAP23025 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
XPAP23025 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPAP23025 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPAP23025 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
XPAP23025 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPAP23025 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPAP23025 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPAP23025 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPAP23025 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPAP23025 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPAP23025 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPAP23025 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPAP23025 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPAP23025 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPAP23025 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPAP23025 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XPAP23025 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XPAP23025 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
XPAP23025 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XPAP23025 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XPAP23025 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XPAP23025 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XPAP23025 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XPAP23025 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XPAP23025 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XPAP23025 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XPAP23025 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
XPAP23025 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
XPAP23025 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XPAP23025 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPAP23025 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPAP23025 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms