Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RFX1P22670 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RFX1P22670 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RFX1P22670 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RFX1P22670 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RFX1P22670 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RFX1P22670 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RFX1P22670 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RFX1P22670 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RFX1P22670 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RFX1P22670 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RFX1P22670 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RFX1P22670 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RFX1P22670 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RFX1P22670 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RFX1P22670 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RFX1P22670 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RFX1P22670 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RFX1P22670 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RFX1P22670 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RFX1P22670 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RFX1P22670 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RFX1P22670 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RFX1P22670 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFX1P22670 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFX1P22670 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFX1P22670 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFX1P22670 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFX1P22670 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFX1P22670 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RFX1P22670 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RFX1P22670 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RFX1P22670 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RFX1P22670 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RFX1P22670 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RFX1P22670 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RFX1P22670 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFX1P22670 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFX1P22670 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RFX1P22670 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RFX1P22670 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFX1P22670 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFX1P22670 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFX1P22670 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFX1P22670 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFX1P22670 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFX1P22670 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFX1P22670 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFX1P22670 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFX1P22670 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFX1P22670 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFX1P22670 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFX1P22670 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RFX1P22670 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFX1P22670 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RFX1P22670 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RFX1P22670 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RFX1P22670 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RFX1P22670 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RFX1P22670 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RFX1P22670 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RFX1P22670 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RFX1P22670 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RFX1P22670 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RFX1P22670 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RFX1P22670 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RFX1P22670 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RFX1P22670 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RFX1P22670 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RFX1P22670 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RFX1P22670 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RFX1P22670 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RFX1P22670 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RFX1P22670 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RFX1P22670 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RFX1P22670 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RFX1P22670 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RFX1P22670 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RFX1P22670 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RFX1P22670 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RFX1P22670 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RFX1P22670 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RFX1P22670 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RFX1P22670 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RFX1P22670 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RFX1P22670 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RFX1P22670 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RFX1P22670 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RFX1P22670 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RFX1P22670 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RFX1P22670 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RFX1P22670 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RFX1P22670 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RFX1P22670 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RFX1P22670 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RFX1P22670 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RFX1P22670 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RFX1P22670 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RFX1P22670 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RFX1P22670 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms