Protein–RNA interactions for Protein: P22459

KCNA4, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA4P22459 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNA4P22459 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNA4P22459 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNA4P22459 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNA4P22459 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNA4P22459 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNA4P22459 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNA4P22459 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNA4P22459 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNA4P22459 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNA4P22459 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNA4P22459 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNA4P22459 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNA4P22459 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNA4P22459 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNA4P22459 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNA4P22459 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNA4P22459 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNA4P22459 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNA4P22459 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNA4P22459 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA4P22459 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 AL603841.1-201ENST00000430516 664 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 ITGB5-AS1-201ENST00000495917 460 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA4P22459 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms