Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpm3P21107 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tpm3P21107 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tpm3P21107 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tpm3P21107 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tpm3P21107 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpm3P21107 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpm3P21107 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpm3P21107 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tpm3P21107 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tpm3P21107 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tpm3P21107 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tpm3P21107 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tpm3P21107 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tpm3P21107 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tpm3P21107 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpm3P21107 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpm3P21107 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpm3P21107 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpm3P21107 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpm3P21107 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpm3P21107 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpm3P21107 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpm3P21107 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpm3P21107 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpm3P21107 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tpm3P21107 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tpm3P21107 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tpm3P21107 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tpm3P21107 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tpm3P21107 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tpm3P21107 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tpm3P21107 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpm3P21107 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpm3P21107 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpm3P21107 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpm3P21107 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpm3P21107 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpm3P21107 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tpm3P21107 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tpm3P21107 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tpm3P21107 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tpm3P21107 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tpm3P21107 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tpm3P21107 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tpm3P21107 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Tpm3P21107 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tpm3P21107 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tpm3P21107 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tpm3P21107 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tpm3P21107 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tpm3P21107 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tpm3P21107 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpm3P21107 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpm3P21107 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpm3P21107 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpm3P21107 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpm3P21107 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpm3P21107 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpm3P21107 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpm3P21107 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpm3P21107 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms