Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PVALBP20472 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PVALBP20472 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PVALBP20472 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PVALBP20472 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PVALBP20472 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PVALBP20472 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PVALBP20472 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PVALBP20472 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PVALBP20472 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PVALBP20472 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PVALBP20472 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PVALBP20472 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PVALBP20472 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PVALBP20472 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PVALBP20472 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PVALBP20472 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PVALBP20472 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PVALBP20472 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PVALBP20472 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PVALBP20472 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PVALBP20472 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PVALBP20472 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PVALBP20472 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PVALBP20472 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PVALBP20472 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PVALBP20472 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PVALBP20472 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PVALBP20472 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PVALBP20472 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PVALBP20472 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PVALBP20472 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PVALBP20472 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PVALBP20472 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PVALBP20472 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PVALBP20472 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PVALBP20472 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PVALBP20472 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PVALBP20472 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PVALBP20472 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PVALBP20472 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PVALBP20472 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PVALBP20472 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PVALBP20472 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PVALBP20472 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PVALBP20472 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PVALBP20472 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PVALBP20472 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PVALBP20472 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PVALBP20472 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PVALBP20472 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PVALBP20472 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PVALBP20472 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PVALBP20472 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PVALBP20472 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PVALBP20472 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PVALBP20472 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PVALBP20472 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PVALBP20472 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PVALBP20472 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PVALBP20472 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PVALBP20472 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PVALBP20472 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PVALBP20472 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PVALBP20472 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PVALBP20472 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PVALBP20472 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PVALBP20472 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PVALBP20472 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PVALBP20472 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PVALBP20472 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PVALBP20472 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PVALBP20472 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PVALBP20472 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PVALBP20472 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PVALBP20472 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PVALBP20472 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PVALBP20472 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PVALBP20472 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PVALBP20472 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PVALBP20472 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PVALBP20472 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PVALBP20472 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PVALBP20472 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PVALBP20472 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PVALBP20472 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PVALBP20472 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PVALBP20472 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PVALBP20472 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PVALBP20472 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PVALBP20472 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PVALBP20472 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PVALBP20472 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PVALBP20472 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PVALBP20472 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PVALBP20472 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PVALBP20472 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PVALBP20472 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PVALBP20472 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PVALBP20472 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms