Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RargP18911 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RargP18911 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RargP18911 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RargP18911 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RargP18911 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RargP18911 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RargP18911 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RargP18911 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RargP18911 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RargP18911 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RargP18911 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RargP18911 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RargP18911 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RargP18911 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RargP18911 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RargP18911 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RargP18911 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RargP18911 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RargP18911 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RargP18911 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RargP18911 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RargP18911 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RargP18911 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RargP18911 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RargP18911 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RargP18911 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RargP18911 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RargP18911 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RargP18911 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RargP18911 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RargP18911 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RargP18911 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RargP18911 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RargP18911 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RargP18911 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RargP18911 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RargP18911 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RargP18911 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RargP18911 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RargP18911 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RargP18911 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RargP18911 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RargP18911 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RargP18911 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RargP18911 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RargP18911 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RargP18911 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RargP18911 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RargP18911 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RargP18911 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RargP18911 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RargP18911 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RargP18911 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RargP18911 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RargP18911 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RargP18911 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RargP18911 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RargP18911 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RargP18911 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RargP18911 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RargP18911 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RargP18911 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RargP18911 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RargP18911 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RargP18911 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RargP18911 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RargP18911 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RargP18911 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RargP18911 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RargP18911 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RargP18911 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RargP18911 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RargP18911 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RargP18911 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RargP18911 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RargP18911 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RargP18911 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RargP18911 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RargP18911 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RargP18911 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RargP18911 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RargP18911 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RargP18911 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RargP18911 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RargP18911 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RargP18911 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RargP18911 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RargP18911 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RargP18911 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RargP18911 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RargP18911 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RargP18911 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RargP18911 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RargP18911 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RargP18911 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RargP18911 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RargP18911 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RargP18911 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RargP18911 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms