Protein–RNA interactions for Protein: P18419

Svs4, Seminal vesicle secretory protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svs4P18419 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Svs4P18419 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Svs4P18419 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Svs4P18419 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Svs4P18419 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Svs4P18419 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Svs4P18419 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Svs4P18419 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Svs4P18419 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Svs4P18419 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
Svs4P18419 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Svs4P18419 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Svs4P18419 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Svs4P18419 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Svs4P18419 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Svs4P18419 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Svs4P18419 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Svs4P18419 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Svs4P18419 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Svs4P18419 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Svs4P18419 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Svs4P18419 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Svs4P18419 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Svs4P18419 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Svs4P18419 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Svs4P18419 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Svs4P18419 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Svs4P18419 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Svs4P18419 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Svs4P18419 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Svs4P18419 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Svs4P18419 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Svs4P18419 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Svs4P18419 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Svs4P18419 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Svs4P18419 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Svs4P18419 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Svs4P18419 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Svs4P18419 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Svs4P18419 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Svs4P18419 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Svs4P18419 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Svs4P18419 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Svs4P18419 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Svs4P18419 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Svs4P18419 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Svs4P18419 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Svs4P18419 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Svs4P18419 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Svs4P18419 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Svs4P18419 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Svs4P18419 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Svs4P18419 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Svs4P18419 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Svs4P18419 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Svs4P18419 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Svs4P18419 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Svs4P18419 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Svs4P18419 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Svs4P18419 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Svs4P18419 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Svs4P18419 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Svs4P18419 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Svs4P18419 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Svs4P18419 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Svs4P18419 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Svs4P18419 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Svs4P18419 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Svs4P18419 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Svs4P18419 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Svs4P18419 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Svs4P18419 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Svs4P18419 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Svs4P18419 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Svs4P18419 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Svs4P18419 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Svs4P18419 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Svs4P18419 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Svs4P18419 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Svs4P18419 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Svs4P18419 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Svs4P18419 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Svs4P18419 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Svs4P18419 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Svs4P18419 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Svs4P18419 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Svs4P18419 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Svs4P18419 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Svs4P18419 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Svs4P18419 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Svs4P18419 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Svs4P18419 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Svs4P18419 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Svs4P18419 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Svs4P18419 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Svs4P18419 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Svs4P18419 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Svs4P18419 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Svs4P18419 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Svs4P18419 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms