Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmga1P17095 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmga1P17095 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmga1P17095 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmga1P17095 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmga1P17095 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmga1P17095 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmga1P17095 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmga1P17095 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmga1P17095 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmga1P17095 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmga1P17095 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmga1P17095 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmga1P17095 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmga1P17095 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmga1P17095 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmga1P17095 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmga1P17095 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmga1P17095 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmga1P17095 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmga1P17095 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmga1P17095 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmga1P17095 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmga1P17095 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmga1P17095 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmga1P17095 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmga1P17095 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmga1P17095 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmga1P17095 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmga1P17095 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmga1P17095 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmga1P17095 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmga1P17095 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmga1P17095 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmga1P17095 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmga1P17095 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmga1P17095 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmga1P17095 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hmga1P17095 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmga1P17095 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmga1P17095 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmga1P17095 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmga1P17095 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmga1P17095 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmga1P17095 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmga1P17095 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmga1P17095 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmga1P17095 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmga1P17095 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmga1P17095 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmga1P17095 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmga1P17095 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmga1P17095 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmga1P17095 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmga1P17095 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmga1P17095 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmga1P17095 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmga1P17095 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmga1P17095 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmga1P17095 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmga1P17095 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmga1P17095 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmga1P17095 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmga1P17095 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmga1P17095 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hmga1P17095 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hmga1P17095 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hmga1P17095 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hmga1P17095 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hmga1P17095 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmga1P17095 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmga1P17095 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmga1P17095 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmga1P17095 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmga1P17095 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmga1P17095 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmga1P17095 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmga1P17095 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmga1P17095 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmga1P17095 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmga1P17095 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmga1P17095 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmga1P17095 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmga1P17095 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmga1P17095 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmga1P17095 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmga1P17095 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmga1P17095 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmga1P17095 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmga1P17095 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmga1P17095 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmga1P17095 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmga1P17095 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmga1P17095 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms