Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPB42P16452 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPB42P16452 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPB42P16452 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPB42P16452 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPB42P16452 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPB42P16452 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPB42P16452 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPB42P16452 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPB42P16452 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPB42P16452 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPB42P16452 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPB42P16452 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPB42P16452 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPB42P16452 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPB42P16452 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPB42P16452 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPB42P16452 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EPB42P16452 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EPB42P16452 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPB42P16452 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPB42P16452 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPB42P16452 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPB42P16452 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPB42P16452 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPB42P16452 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPB42P16452 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPB42P16452 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPB42P16452 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPB42P16452 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPB42P16452 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPB42P16452 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPB42P16452 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPB42P16452 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPB42P16452 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EPB42P16452 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPB42P16452 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPB42P16452 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPB42P16452 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPB42P16452 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPB42P16452 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPB42P16452 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPB42P16452 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPB42P16452 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPB42P16452 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPB42P16452 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPB42P16452 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPB42P16452 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPB42P16452 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPB42P16452 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPB42P16452 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPB42P16452 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPB42P16452 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPB42P16452 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPB42P16452 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPB42P16452 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EPB42P16452 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EPB42P16452 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPB42P16452 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPB42P16452 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPB42P16452 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPB42P16452 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EPB42P16452 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EPB42P16452 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPB42P16452 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPB42P16452 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPB42P16452 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPB42P16452 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPB42P16452 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPB42P16452 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPB42P16452 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPB42P16452 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPB42P16452 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPB42P16452 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPB42P16452 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPB42P16452 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPB42P16452 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPB42P16452 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPB42P16452 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPB42P16452 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPB42P16452 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPB42P16452 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPB42P16452 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPB42P16452 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPB42P16452 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPB42P16452 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPB42P16452 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPB42P16452 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPB42P16452 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPB42P16452 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EPB42P16452 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPB42P16452 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPB42P16452 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPB42P16452 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPB42P16452 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPB42P16452 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPB42P16452 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPB42P16452 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPB42P16452 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPB42P16452 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms