Protein–RNA interactions for Protein: P16390

Kcna3, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna3P16390 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kcna3P16390 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Kcna3P16390 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kcna3P16390 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kcna3P16390 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kcna3P16390 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kcna3P16390 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kcna3P16390 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kcna3P16390 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kcna3P16390 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kcna3P16390 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kcna3P16390 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kcna3P16390 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kcna3P16390 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kcna3P16390 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kcna3P16390 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kcna3P16390 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kcna3P16390 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kcna3P16390 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kcna3P16390 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kcna3P16390 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kcna3P16390 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Kcna3P16390 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kcna3P16390 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kcna3P16390 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kcna3P16390 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kcna3P16390 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kcna3P16390 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kcna3P16390 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kcna3P16390 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kcna3P16390 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kcna3P16390 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kcna3P16390 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kcna3P16390 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kcna3P16390 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Kcna3P16390 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kcna3P16390 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kcna3P16390 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kcna3P16390 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Kcna3P16390 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Kcna3P16390 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kcna3P16390 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kcna3P16390 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Kcna3P16390 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Kcna3P16390 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Kcna3P16390 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kcna3P16390 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kcna3P16390 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kcna3P16390 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kcna3P16390 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kcna3P16390 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Kcna3P16390 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kcna3P16390 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kcna3P16390 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kcna3P16390 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Kcna3P16390 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kcna3P16390 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kcna3P16390 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kcna3P16390 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Kcna3P16390 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kcna3P16390 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kcna3P16390 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kcna3P16390 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kcna3P16390 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kcna3P16390 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.53■■■□□ 2
Kcna3P16390 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Kcna3P16390 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kcna3P16390 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Kcna3P16390 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kcna3P16390 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kcna3P16390 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kcna3P16390 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kcna3P16390 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Kcna3P16390 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kcna3P16390 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kcna3P16390 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kcna3P16390 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kcna3P16390 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kcna3P16390 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kcna3P16390 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kcna3P16390 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kcna3P16390 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kcna3P16390 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kcna3P16390 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kcna3P16390 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kcna3P16390 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kcna3P16390 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kcna3P16390 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kcna3P16390 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kcna3P16390 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kcna3P16390 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kcna3P16390 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Kcna3P16390 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kcna3P16390 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Kcna3P16390 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Kcna3P16390 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Kcna3P16390 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Kcna3P16390 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Kcna3P16390 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Kcna3P16390 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms