Protein–RNA interactions for Protein: P16125

Ldhb, L-lactate dehydrogenase B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdhbP16125 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LdhbP16125 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LdhbP16125 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LdhbP16125 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LdhbP16125 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LdhbP16125 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LdhbP16125 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LdhbP16125 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LdhbP16125 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LdhbP16125 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LdhbP16125 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LdhbP16125 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LdhbP16125 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LdhbP16125 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LdhbP16125 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LdhbP16125 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LdhbP16125 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LdhbP16125 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LdhbP16125 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LdhbP16125 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LdhbP16125 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LdhbP16125 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LdhbP16125 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LdhbP16125 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LdhbP16125 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LdhbP16125 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LdhbP16125 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LdhbP16125 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LdhbP16125 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LdhbP16125 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LdhbP16125 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LdhbP16125 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LdhbP16125 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LdhbP16125 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LdhbP16125 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LdhbP16125 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LdhbP16125 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LdhbP16125 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LdhbP16125 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LdhbP16125 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LdhbP16125 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LdhbP16125 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LdhbP16125 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LdhbP16125 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LdhbP16125 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LdhbP16125 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LdhbP16125 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LdhbP16125 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LdhbP16125 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LdhbP16125 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LdhbP16125 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LdhbP16125 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LdhbP16125 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LdhbP16125 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LdhbP16125 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LdhbP16125 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LdhbP16125 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LdhbP16125 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LdhbP16125 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LdhbP16125 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LdhbP16125 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LdhbP16125 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LdhbP16125 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LdhbP16125 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LdhbP16125 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LdhbP16125 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LdhbP16125 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LdhbP16125 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LdhbP16125 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LdhbP16125 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LdhbP16125 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LdhbP16125 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LdhbP16125 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LdhbP16125 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LdhbP16125 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LdhbP16125 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LdhbP16125 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LdhbP16125 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LdhbP16125 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LdhbP16125 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LdhbP16125 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LdhbP16125 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LdhbP16125 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LdhbP16125 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LdhbP16125 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LdhbP16125 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LdhbP16125 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LdhbP16125 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LdhbP16125 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LdhbP16125 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LdhbP16125 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LdhbP16125 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LdhbP16125 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LdhbP16125 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LdhbP16125 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LdhbP16125 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LdhbP16125 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LdhbP16125 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LdhbP16125 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LdhbP16125 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms