Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
VEGFAP15692 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
VEGFAP15692 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
VEGFAP15692 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
VEGFAP15692 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
VEGFAP15692 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VEGFAP15692 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
VEGFAP15692 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VEGFAP15692 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
VEGFAP15692 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
VEGFAP15692 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
VEGFAP15692 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VEGFAP15692 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
VEGFAP15692 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VEGFAP15692 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VEGFAP15692 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
VEGFAP15692 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
VEGFAP15692 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
VEGFAP15692 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
VEGFAP15692 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
VEGFAP15692 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
VEGFAP15692 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
VEGFAP15692 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
VEGFAP15692 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
VEGFAP15692 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
VEGFAP15692 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
VEGFAP15692 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VEGFAP15692 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
VEGFAP15692 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VEGFAP15692 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
VEGFAP15692 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
VEGFAP15692 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VEGFAP15692 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VEGFAP15692 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VEGFAP15692 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
VEGFAP15692 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VEGFAP15692 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VEGFAP15692 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VEGFAP15692 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VEGFAP15692 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
VEGFAP15692 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
VEGFAP15692 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VEGFAP15692 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
VEGFAP15692 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
VEGFAP15692 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
VEGFAP15692 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VEGFAP15692 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VEGFAP15692 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
VEGFAP15692 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VEGFAP15692 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VEGFAP15692 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VEGFAP15692 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VEGFAP15692 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VEGFAP15692 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VEGFAP15692 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
VEGFAP15692 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VEGFAP15692 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
VEGFAP15692 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
VEGFAP15692 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
VEGFAP15692 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
VEGFAP15692 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
VEGFAP15692 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
VEGFAP15692 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
VEGFAP15692 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
VEGFAP15692 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms