Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme1P15532 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nme1P15532 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nme1P15532 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nme1P15532 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Nme1P15532 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Nme1P15532 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Nme1P15532 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nme1P15532 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nme1P15532 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Nme1P15532 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nme1P15532 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nme1P15532 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nme1P15532 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nme1P15532 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nme1P15532 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nme1P15532 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Nme1P15532 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme1P15532 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme1P15532 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme1P15532 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms