Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-D1P14427 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-D1P14427 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-D1P14427 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-D1P14427 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-D1P14427 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-D1P14427 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-D1P14427 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-D1P14427 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-D1P14427 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-D1P14427 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-D1P14427 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-D1P14427 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-D1P14427 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-D1P14427 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-D1P14427 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-D1P14427 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-D1P14427 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-D1P14427 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-D1P14427 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-D1P14427 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-D1P14427 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-D1P14427 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-D1P14427 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-D1P14427 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-D1P14427 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-D1P14427 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-D1P14427 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms