Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCL2P13500 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCL2P13500 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCL2P13500 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCL2P13500 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCL2P13500 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCL2P13500 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCL2P13500 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCL2P13500 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCL2P13500 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCL2P13500 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCL2P13500 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCL2P13500 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCL2P13500 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCL2P13500 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCL2P13500 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCL2P13500 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCL2P13500 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCL2P13500 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCL2P13500 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCL2P13500 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCL2P13500 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCL2P13500 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCL2P13500 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCL2P13500 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCL2P13500 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCL2P13500 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCL2P13500 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCL2P13500 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCL2P13500 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCL2P13500 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCL2P13500 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCL2P13500 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCL2P13500 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCL2P13500 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCL2P13500 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCL2P13500 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCL2P13500 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCL2P13500 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCL2P13500 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCL2P13500 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCL2P13500 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCL2P13500 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCL2P13500 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCL2P13500 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCL2P13500 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCL2P13500 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCL2P13500 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCL2P13500 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCL2P13500 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCL2P13500 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCL2P13500 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCL2P13500 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCL2P13500 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCL2P13500 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCL2P13500 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCL2P13500 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCL2P13500 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCL2P13500 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCL2P13500 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCL2P13500 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCL2P13500 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCL2P13500 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCL2P13500 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCL2P13500 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCL2P13500 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCL2P13500 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL2P13500 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL2P13500 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL2P13500 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL2P13500 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL2P13500 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL2P13500 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL2P13500 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL2P13500 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL2P13500 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL2P13500 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL2P13500 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL2P13500 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL2P13500 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL2P13500 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL2P13500 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL2P13500 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL2P13500 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL2P13500 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL2P13500 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL2P13500 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL2P13500 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL2P13500 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL2P13500 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL2P13500 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL2P13500 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL2P13500 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL2P13500 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL2P13500 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL2P13500 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL2P13500 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL2P13500 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL2P13500 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL2P13500 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms