Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXD8P13378 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXD8P13378 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXD8P13378 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXD8P13378 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXD8P13378 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXD8P13378 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXD8P13378 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXD8P13378 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXD8P13378 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXD8P13378 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXD8P13378 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXD8P13378 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXD8P13378 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXD8P13378 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXD8P13378 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXD8P13378 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXD8P13378 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXD8P13378 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXD8P13378 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXD8P13378 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXD8P13378 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXD8P13378 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXD8P13378 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXD8P13378 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXD8P13378 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXD8P13378 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXD8P13378 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXD8P13378 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXD8P13378 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXD8P13378 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXD8P13378 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXD8P13378 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXD8P13378 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXD8P13378 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXD8P13378 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXD8P13378 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXD8P13378 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXD8P13378 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXD8P13378 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXD8P13378 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXD8P13378 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXD8P13378 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXD8P13378 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXD8P13378 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXD8P13378 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXD8P13378 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXD8P13378 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXD8P13378 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXD8P13378 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXD8P13378 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXD8P13378 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXD8P13378 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXD8P13378 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXD8P13378 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXD8P13378 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXD8P13378 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms