Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Calb1P12658 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Calb1P12658 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Calb1P12658 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Calb1P12658 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Calb1P12658 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Calb1P12658 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Calb1P12658 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Calb1P12658 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Calb1P12658 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Calb1P12658 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Calb1P12658 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Calb1P12658 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Calb1P12658 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Calb1P12658 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Calb1P12658 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Calb1P12658 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Calb1P12658 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Calb1P12658 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Calb1P12658 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Calb1P12658 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Calb1P12658 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Calb1P12658 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Calb1P12658 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Calb1P12658 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Calb1P12658 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Calb1P12658 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Calb1P12658 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Calb1P12658 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Calb1P12658 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Calb1P12658 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Calb1P12658 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Calb1P12658 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Calb1P12658 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Calb1P12658 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Calb1P12658 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Calb1P12658 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Calb1P12658 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Calb1P12658 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Calb1P12658 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Calb1P12658 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Calb1P12658 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Calb1P12658 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Calb1P12658 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Calb1P12658 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Calb1P12658 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Calb1P12658 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Calb1P12658 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Calb1P12658 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Calb1P12658 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Calb1P12658 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Calb1P12658 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Calb1P12658 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Calb1P12658 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Calb1P12658 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Calb1P12658 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Calb1P12658 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Calb1P12658 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Calb1P12658 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Calb1P12658 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Calb1P12658 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Calb1P12658 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Calb1P12658 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Calb1P12658 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Calb1P12658 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Calb1P12658 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Calb1P12658 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Calb1P12658 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Calb1P12658 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Calb1P12658 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Calb1P12658 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Calb1P12658 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Calb1P12658 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Calb1P12658 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Calb1P12658 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Calb1P12658 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Calb1P12658 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Calb1P12658 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Calb1P12658 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Calb1P12658 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Calb1P12658 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Calb1P12658 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Calb1P12658 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Calb1P12658 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Calb1P12658 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Calb1P12658 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Calb1P12658 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Calb1P12658 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Calb1P12658 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Calb1P12658 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calb1P12658 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calb1P12658 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calb1P12658 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Calb1P12658 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Calb1P12658 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Calb1P12658 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Calb1P12658 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Calb1P12658 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Calb1P12658 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Calb1P12658 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms