Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPREB1P12018 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VPREB1P12018 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms