Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTHFD1P11586 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTHFD1P11586 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTHFD1P11586 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MTHFD1P11586 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTHFD1P11586 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MTHFD1P11586 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MTHFD1P11586 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MTHFD1P11586 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MTHFD1P11586 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTHFD1P11586 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTHFD1P11586 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTHFD1P11586 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTHFD1P11586 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTHFD1P11586 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTHFD1P11586 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTHFD1P11586 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTHFD1P11586 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTHFD1P11586 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTHFD1P11586 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTHFD1P11586 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTHFD1P11586 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTHFD1P11586 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MTHFD1P11586 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MTHFD1P11586 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms