Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DMDP11532 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DMDP11532 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DMDP11532 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DMDP11532 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DMDP11532 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DMDP11532 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DMDP11532 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DMDP11532 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DMDP11532 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DMDP11532 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DMDP11532 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DMDP11532 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DMDP11532 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DMDP11532 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DMDP11532 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DMDP11532 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DMDP11532 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DMDP11532 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DMDP11532 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DMDP11532 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DMDP11532 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DMDP11532 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DMDP11532 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DMDP11532 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DMDP11532 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DMDP11532 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DMDP11532 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DMDP11532 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DMDP11532 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DMDP11532 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DMDP11532 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DMDP11532 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DMDP11532 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DMDP11532 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DMDP11532 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DMDP11532 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DMDP11532 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DMDP11532 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DMDP11532 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DMDP11532 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DMDP11532 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DMDP11532 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DMDP11532 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DMDP11532 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DMDP11532 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DMDP11532 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DMDP11532 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DMDP11532 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DMDP11532 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DMDP11532 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DMDP11532 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DMDP11532 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DMDP11532 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DMDP11532 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DMDP11532 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DMDP11532 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DMDP11532 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DMDP11532 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DMDP11532 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DMDP11532 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DMDP11532 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DMDP11532 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DMDP11532 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DMDP11532 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DMDP11532 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DMDP11532 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DMDP11532 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DMDP11532 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DMDP11532 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DMDP11532 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DMDP11532 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DMDP11532 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DMDP11532 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DMDP11532 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DMDP11532 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DMDP11532 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DMDP11532 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DMDP11532 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DMDP11532 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DMDP11532 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DMDP11532 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DMDP11532 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DMDP11532 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DMDP11532 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DMDP11532 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DMDP11532 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DMDP11532 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DMDP11532 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DMDP11532 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DMDP11532 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DMDP11532 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DMDP11532 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DMDP11532 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DMDP11532 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DMDP11532 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DMDP11532 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DMDP11532 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DMDP11532 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DMDP11532 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms